Dados do Tribunal Superior Eleitoral revelam que São João Batista possui 23 partidos políticos constituídos e 3.581 filiados as siglas. Isso significa que 17% dos 20.668 eleitores batistenses tem vinculação com algum partido. Entre as maiores agremiações da cidade estão PMDB, PP, PSD, DEM, PTB e PSB. Nove partidos tem no máximo 30 filiados, e 90% dos filiados estão concentrados em 10 siglas.